Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms