Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLE3Q9NRF9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms