Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN5Q9NRC6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPTBN5Q9NRC6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN5Q9NRC6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN5Q9NRC6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN5Q9NRC6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN5Q9NRC6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN5Q9NRC6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN5Q9NRC6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN5Q9NRC6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms