Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM5Q9NQX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM5Q9NQX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM5Q9NQX1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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