Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM8Q9NQV8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM8Q9NQV8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms