Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 CEPT1-202ENST00000460443 851 ntTSL 517.06■□□□□ 0.328e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 CEPT1-209ENST00000498239 1957 ntTSL 1 (best)10.41□□□□□ -0.748e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 CEPT1-205ENST00000476865 783 ntTSL 510.3□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 CEPT1-201ENST00000357172 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 CEPT1-210ENST00000545121 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 CEPT1-207ENST00000480324 2110 ntTSL 28.5□□□□□ -1.058e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 CEPT1-206ENST00000478042 2175 ntTSL 56.8□□□□□ -1.328e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.378e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.385e-7■■■■■ 32.2
EXOSC5Q9NQT4 LEPR-206ENST00000462765 2117 ntTSL 1 (best)14.89□□□□□ -0.039e-7■■■■■ 32.2
EXOSC5Q9NQT4 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 32.2
EXOSC5Q9NQT4 LEPR-204ENST00000371059 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.829e-7■■■■■ 32.2
EXOSC5Q9NQT4 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.569e-7■■■■■ 32.2
EXOSC5Q9NQT4 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.629e-7■■■■■ 32.2
EXOSC5Q9NQT4 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.999e-7■■■■■ 32.2
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-222ENST00000561074 550 ntTSL 46.13□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 32.2
EXOSC5Q9NQT4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 32.2
EXOSC5Q9NQT4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 32.2
EXOSC5Q9NQT4 RPS4Y1-202ENST00000430575 811 ntTSL 34.73□□□□□ -1.659e-8■■■■■ 32.1
EXOSC5Q9NQT4 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.889e-8■■■■■ 32.1
EXOSC5Q9NQT4 MIR548XHG-201ENST00000355189 673 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 32.1
EXOSC5Q9NQT4 MIR548XHG-202ENST00000414582 615 ntTSL 35.38□□□□□ -1.551e-7■■■■■ 32.1
EXOSC5Q9NQT4 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.91e-7■■■■■ 32.1
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 32.1
EXOSC5Q9NQT4 YY1AP1-202ENST00000311573 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 32.1
EXOSC5Q9NQT4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZCCHC2-202ENST00000585873 5652 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZCCHC2-210ENST00000591632 608 ntTSL 314.81□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZCCHC2-211ENST00000621048 704 ntTSL 314.04□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZNF780A-207ENST00000595773 546 ntTSL 513.01□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZNF780A-209ENST00000599972 498 ntTSL 211.57□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZNF780A-206ENST00000595687 3472 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZNF780A-201ENST00000340963 3674 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 AC005614.2-201ENST00000595508 461 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.215e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZNF780A-202ENST00000414720 2396 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.215e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.535e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZNF780A-211ENST00000601715 446 ntTSL 24.73□□□□□ -1.655e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.665e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZNF780A-208ENST00000599368 665 ntTSL 24.35□□□□□ -1.715e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ZNF780A-210ENST00000601688 467 ntTSL 1 (best)3.22□□□□□ -1.895e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.171e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 GPR75-ASB3-203ENST00000498475 736 ntTSL 518.97■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.471e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ASB3-211ENST00000482829 1910 ntTSL 511.22□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 LINC00923-201ENST00000503768 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 LINC00923-202ENST00000503874 1460 ntTSL 1 (best)9.87□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.371e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 LINS1-211ENST00000560941 588 ntTSL 56.48□□□□□ -1.371e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 LINS1-202ENST00000559149 2477 ntTSL 25.82□□□□□ -1.481e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 LINS1-204ENST00000559577 827 ntTSL 55.3□□□□□ -1.561e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 AL359915.2-204ENST00000413531 1154 ntTSL 1 (best)5.28□□□□□ -1.561e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ASB3-207ENST00000470916 581 ntTSL 55.08□□□□□ -1.61e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.671e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.681e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 LINS1-205ENST00000559736 872 ntTSL 34.19□□□□□ -1.741e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ACVR1-203ENST00000410057 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 TNIK-206ENST00000460047 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 TNIK-214ENST00000488470 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ACVR1-202ENST00000409283 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.19□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.761e-6■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 GALNT16-203ENST00000553471 5548 ntTSL 514.06□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 GALNT16-205ENST00000553740 520 ntTSL 46.45□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 ATG5-206ENST00000476518 602 ntTSL 32.97□□□□□ -1.934e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 HERC2P2-201ENST00000613386 5181 ntBASIC9.92□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 HERC2P2-205ENST00000619021 5746 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 RFX7-202ENST00000559847 4165 ntTSL 1 (best)3.99□□□□□ -1.771e-8■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 212.39□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 511.88□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)10.93□□□□□ -0.667e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 510.54□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 37.79□□□□□ -1.167e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 NCKAP1-208ENST00000495619 665 ntTSL 34.64□□□□□ -1.676e-7■■■■■ 32
EXOSC5Q9NQT4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 31.9
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 43.5 ms