Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN4Q9NQP4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.3 ms