Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMX1Q9NP08 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMX1Q9NP08 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMX1Q9NP08 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMX1Q9NP08 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMX1Q9NP08 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMX1Q9NP08 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMX1Q9NP08 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMX1Q9NP08 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMX1Q9NP08 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMX1Q9NP08 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMX1Q9NP08 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms