Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms