Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHEJ1Q9H9Q4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms