Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4CQ9C0C4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms