Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZCCHC2Q9C0B9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC2Q9C0B9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC2Q9C0B9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms