Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms