Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM6SF2Q9BZW4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms