Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM8Q9BZR9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms