Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PUS3Q9BZE2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PUS3Q9BZE2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms