Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC8Q9BY41 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC8Q9BY41 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms