Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A2Q9BY10 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A2Q9BY10 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms