Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms