Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA5Q9BWX5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA5Q9BWX5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms