Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP1Q9BWH6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP1Q9BWH6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms