Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms