Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms