Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIKE1Q9BRV8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIKE1Q9BRV8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms