Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOK1Q9BRS2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms