Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPIN3Q9BQK8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms