Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN18Q99952 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN18Q99952 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN18Q99952 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms