Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPAS2Q99743 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms