Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS8Q99627 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms