Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
RSF1Q96T23 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RSF1Q96T23 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
RSF1Q96T23 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
RSF1Q96T23 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC42.04■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms