Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A2Q96QD8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A2Q96QD8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms