Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UHRF2Q96PU4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UHRF2Q96PU4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UHRF2Q96PU4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UHRF2Q96PU4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UHRF2Q96PU4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms