Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD11Q96NU1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SAMD11Q96NU1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms