Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1Q96NA8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms