Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JSRP1Q96MG2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms