Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms