Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC17Q96LX7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms