Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCHS1Q96JQ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCHS1Q96JQ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCHS1Q96JQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms