Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EAF1Q96JC9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms