Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms