Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC97Q96F63 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms