Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MVB12AQ96EY5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVB12AQ96EY5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVB12AQ96EY5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms