Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TVP23CQ96ET8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TVP23CQ96ET8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23CQ96ET8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms