Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHFRQ96EP1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHFRQ96EP1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms