Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHDC3Q96DC8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECHDC3Q96DC8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHDC3Q96DC8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.3 ms