Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI1

SLC22A18, Solute carrier family 22 member 18, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A18Q96BI1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A18Q96BI1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms