Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN3Q969G5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms