Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
PRG4Q92954 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRG4Q92954 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms