Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT35Q92764 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT35Q92764 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms