Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF3Q92576 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF3Q92576 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF3Q92576 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF3Q92576 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF3Q92576 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF3Q92576 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF3Q92576 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF3Q92576 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms